HALÍK, T.: O přítomnou církev a společnost. 1.vyd. Praha, Křesťanská akademie Praha, 1992, 78 s. ISBN 80-900615-5-9.

HALÍK, T.: Sedm úvah o službě nemocným a trpícím. 1.vyd. Brno, Cesta 1993, 59 s. ISBN 80?85319?27?6

HALÍK, T.: Du wirst das Angesicht der erde erneuern. Kirche und Gesellschaft an der Schwelle zur Freiheit. 1.vyd. Leipzig, Benno-Verl., 1993, 129 s., ISBN 3-7462-1079-8

HALÍK, T.: Víra a kultura. 1.vyd. Praha, Zvon 1995, 207 s., ISBN 80-7113-117-2.

HALÍK, T.: Un proyecto de renovación espiritual. 1.vyd. Madrid, Narcea, 1996

HALÍK, T., JANDOUREK J: Ptal jsem se cest. 1. vydání. Praha, Portál 1997

HALÍK T., Wyzwoleni, jesze nie wolni. Poznan, W drodze 1997

HALÍK T., "Mistica, anima della filosofia?" , Fondazione nazionale "Vito Fazio-Allmayer", Palermo 1999 (z češtiny přel. L.Ehrenbergerová )

HALÍK T., Radzilem sie dróg. Poznaň. W drodze. Přel. Adrzej Babuchowski a Jaroslaw Babuchowski. 2001

HALIK, T.: Co je bez chvění, není pevné. Praha, Lidové noviny 2002

HALIK, T.: Oslovit Zachea. Praha, Lidové noviny 2003

HALIK, T.: Co nie jest chwiejne, jest nietrwałe - polský překlad knihy Co je bez Chvění, není pevné; přeložil Juliusz Zychowicz, předmluvu napsal Václav Havel. Vydalo Wydawnictwo WAM, Kraków 2004

HALIK, T.: Vzýván i nevzýván, Evropské přednášky k filozofii a sociologii dějin křesťanství, nakladatelství Lidové noviny, Praha 2004, 376 str., ISBN 80-7106-692-3

HALIK, T.: Noc zpovědníka, Paradoxy malé víry v postoptimistické době, nakladatelství Lidové noviny, Praha 2005, 256 stran, ISBN 80-7106-777-6

HALIK, T.: Prolínání světů, Ze života světových náboženství, nakladatelství Lidové noviny, Praha 2006, 264 stran, ISBN 80-7106-834-9

HALIK, T.: Vzdáleným nablízku, Vášeň a trpělivost v setkání víry s nevírou, nakladatelství Lidové noviny, Praha 2007, 252 stran, ISBN 978-80-7106-907-2

HALIK, T.: Máš před sebou všechny mé cesty, nakladatelství Lidové noviny, Praha 2008, 432 stran

HALIK, T.: Dotkni se ran, nakladatelství Lidové noviny, Praha 2008, 252 stran, ISBN 978-80-7106-979-9

HALIK, T.: Stromu zbývá naděje, nakladatelství Lidové noviny, Praha 2009, 232 stran, ISBN 978-80-7106-989-8

HALÍK, T.: Cesta poznání. In: Laudatio ke 40. narozeninám Z.Neubauera. Praha, Samizdat, 1972.

HALÍK, T.: Ego dormio. In: Hostina. ed. HAVEL, V., Praha, samizdatová edice Expedice, 1985.

HALÍK, T.: Archetypy v díle Karla Čapka. In: Acta Čapkiana,. Praha, SBČ, 1987, 155s. ( 116-133)

KALYPTON ( pseudon. HALÍK, T.): Živý Kristus. in: Miscellanea. Nové cesty myšlení. Praha, Samizdat 1987, s.36-53.

HALÍK, T.: Ego dormio. in: Hostina. Toronto, Sixty-eight P.C., 1989, 309s. (s.149-176), ISBN 0-88781-207-4

HALÍK, T.: Gedanken zur Erneuerung des Lebens der Kirche in unserem Land. In: Chance und Bedrohung der Kirche Heute. Augsburg 1990, 144s., (s.71-82)

HALÍK, T.: The problematic nature of existence and the religious dimension. In: sb. VII.Nova Spes International Colloqium. Prague November 1990, s.1-9.

HALÍK, T.: Die Kirche und der Gesellschaft in der Tschechoslowakei. In: Krafte zum Leben in Europa. Leipzig, Benno Verlag, 1990, 80s., (s.24-31), ISBN 3-7462-100-3

HALÍK, T.: Školy duchovního života. In: Křesťanství, kultura a svět. Praha, Křesťanská akademie, 1991, 146s. (s.61-74), ISBN 80-900615-0-8

HALÍK, T.: Die Rückkehr der Kirche in das öffentliche Leben in der CSFR. In: Die Entwicklung der Beziehung zwischen Kirche und Staat. Wien, Universität Wien, 1991, 131s. ( s.80-84)

HALÍK, T.: The Mission of Christians in today's Central and Eastern Europe. In: First International Conference on Social Values. Cambridge, University of Cambridge, 1991, 226s. (s.161-163)

HALÍK, T.: Sociální nauka církve. Křesťan a politika. Praha, Křesťanská akademie, 1992, 62s. (s.33-38), ISBN 80-900615-4-0

HALÍK, T.: Ego dormio. In: Good-bye, samizdat, ed. GOETZ-STANKIEWICZ, M., Evanston, Northwestern University Press, 1992, 309s. (s.275-284)

HALÍK, T.: Les taches des chretiens en Tchecoslovaquie. In: La signification culturelle du pays frontiere pour l'unification de l'Europe. Osek, Abbaye d'Osek, 1992, 46s. (s.32-41)

HALÍK, T.: Gedanken zur Erneurung der Kirche in der CSFR. In: Zwischen der Zeiten. Leizig, Benno Verlag, 1993, 224s. (s.144-151), ISBN 3-7462-0618-9

HALÍK, T.: Pastoral nach der Wende. In: Abbrüche, Umbrüche, Aufbrüche. Leipzig, Benno Verlag, 1993, 260s. (s.237-247), ISBN 3-7462-1054-2.

HALÍK, T.: Utrpení je tajemství. In: Bolest je výzva k cestě. Praha, Občanské sdružení Porozumění, 1993, 78s. (s.72-75)

HALÍK, T.: Verantwortung für die Utergrundkirche in der Tschechoslovakei. In: G.Virt /Hrsg./. Wien, Universität Wien, 1993, s.117-129.

HALÍK, T.: Předmluva. In: ŠTAMPACH, ODILO I., Život, duch a všechno. Brno, Sursum, 1993, s.145 (s.5-8), ISBN 80-85799-02-2

HALÍK, T.: Świadectvo z czasov prześladowania kosciola w Czechoslowacji. In: Świadectwo kosciola katolickiego. Lublin, KUL, 1994, 359s. (s.133-140)

HALÍK, T.: Starost o svobodu. In: Liberalismus konce 20.století. Praha, Občanský institut, 1994, s.149 (s.67-70), ISBN 80-900190-9-9

HALÍK, T.: Svatý Václav a dílo obnovy. In: Svatý Václav v umění 17. a 18. století. ed. ROYT, J., Praha, Národní galerie, 1994, s.47 (s.5-6), ISBN 80-7035-077-6

HALÍK, T.: In: Kardinál Tomášek. ed. HARTMAN J., SVOBODA B., VAŠKO V., Praha, Zvon, 1994, s.209 (vlastního textu 10%), ISBN 80-7113-093-1

HALÍK, T.: In: Kardinál Tomášek. ed. HARTMAN J., Leipzig, Benno Verlag, 1994, s.185(vlastní podíl 10%), ISBN 3-89543-023-4

HALÍK, T.: Hus a český katolicismus. In: Jan Hus mezi epochami, národy a konfesemi. ed. LÁŠEK, J. B., Praha, ČKA, 1995, 333s. (s.311-313), ISBN 80-85-795-17-5

HALÍK, T.: Biblické pojetí pravdy a jeho teologická reflexe. In: Veritas Vincit. Praha, AV ČR, 1995, 110s. (s.60-64), ISBN 80-85917-10-6

HALÍK, T.: Úvod k českému vydání. In: HUGO ENOMYIA-LASSALLE, H.M., Zenová meditace. Brno, Cesta, 1995, 162s. (s.3-12), ISBN 80-85319-40-3

HALÍK, T.: Úvodní studie. In: Sociální encykliky. Praha, Zvon, 1996, (v tisku)

HALÍK, T.: O základech morálky a postoji ke zlu. In: MATOUŠEK, O. et al.: Stačí odplata? Praha, Portál, 1996, kap.24

HALÍK, T.: Miteinander sprechen - miteinander schweigen. In: Röser J. (Hrsg.), Mehr Himmel wagen. Spurensuche in Gesellschaft, Kultur, Kirche, Freiburg, Herder 1999

HALÍK, T.: The Philosophical View of the Holocaust Phenomenon, in: sb.Education on the Holocaust,Via perfecta, Praha 1999, str. 9-12

HALÍK, T.: Rückehr nach Europa, in: Ost-West, Europäische Perspektiven. Vyd. Matthias-Grünewald-Verlag, Mainz 2001, str.3-9

HALÍK, T.: Christsein in Europa am Beginn des neuen Jahrhunderts, in: sb. Tatkräftig - Engagiert - Überzeugend. , Landeskomittee der Katholiken in Bayern. München 2001 str. 12-24

HALÍK, T.: Partnerschaft zwischen Ost und West in: Renovabis faciem terrae. Kirchliches Leben in Mittel- und Osteuropa an der Jahrtausendwende, (Hrsg. Albert G., Odelelmann J.), 2000, Verl.Paulinus, Trier, 1 vyd.s.295-303. ISBN 3-7902-0067-0

HALÍK, T.: Duchovní rozměr české společnosti, in: Co daly naše země Evropě a lidstvu, II.část, 1.vyd. 2000, Evropský literární klub, Praha, (I.M.Havel, D.Třeštík hl. redaktoři), s. 25-45. ISBN80-86316-10-6

HALÍK, T.: Nejen - ale i. Drobné poznámky o víře. In: Cesty víry. 2000. 1vyd., G plus G.Praha , Gál,F. ed.s.63-86. ISBN 80-86103-33-1

HALÍK, T.: Katolická církev v české republice po r. 1989, in: sb. Společnost v přerodu. Češi ve 20.století. , Masarykův ústav ČSAV, Praha 2000, s. 144-158

HALÍK, T., The Universality and Symbolic Character of Human Rights, , in sb. The New International Law, vyd. Foundation for International Studies, Vilémov Castle, 2000, str. 34-38

HALÍK, T.: Nový světový řád a náboženství. In: Střet civilizací? Praha, ELK, 2002

HALÍK, T. : Atheismus als eine Art religiöser Erfahrung. In: Mühleiesen, H. (Hg.): Visionen in einer Welt ohne Religion, Katholische Akademie, Freiburg 2002 ISBN 3-928698-19-2

HALÍK, T.: Rückehr nach Europa, in: Ost-West, Europäische Perspektiven. Vyd. Matthias-Grünewald-Verlag, Mainz 2001, str.3-9

HALÍK, T.: Christsein in Europa am Beginn des neuen Jahrhunderts, in: sb. Tatkräftig - Engagiert - Überzeugend. , Landeskomittee der Katholiken in Bayern. München 2001 str. 12-24

HALÍK, Tomáš: The post-Tolerance Age, in: Kosmas. Czechoslovak and Central European Journal, Vol. 16, 2002, No 1, s.87-92 ISNN 1056-005X

HALÍK, Tomáš: The Churches in Civil Society, in: Kosmas. Czechoslovak and Central European Journal, Vol. 16, 2002, No 1, s. 93-96 ISNN 1056-005X

HALÍK, Tomáš : Impuls 99 - zkušenost s utvářením demokratické kultury, in: editor: Nekvapil, Václav V.: Impuls pro občanskou společnost , 1.vyd. Praha: Evropský literární klub; 2003, s. 19 - 26 ISBN 80-86316-53-X

HALÍK, Tomáš : Nieodzowny ciezar winy , in: Teologia polityczna, Warszawa 2003, ISSN 1731-4232, str. 54- 56. Polsky, přel. M.A. Cichocki.

HALÍK, T.: C.G.Jung a psychologie archetypů. ed.Traugottová, D., Praha, Kabinet psychoterapie FVL UK 1989, 78s., (s.1-8).

HALÍK, T.: A Czech voice. in: The Special Bishops synod on Europe, ed. Pax Christi International Brussels 1992, 52s., (s.28-30).

HALÍK, T.: Mládež a mravní obnova národa. in: Skautský seminář. Praha, Ekumenická LŠ 1992, 120s., (s.34-43).

HALÍK, T.: Večerní modlitby. Brno, Cesta 1993, 98s. ISBN 80-85-319-21-7

HALÍK, T.: Heilung der Wunden der Vergangenheit. in: Versohnung Gabe Gottes und Quelle neuen Lebens. St.Galen, CCEE und KEK, 1995, 45s., (s.20-22).

HALÍK, T., KUCHYŇKA, Z.: Člověk a konflikty. 2.vyd Praha, Institut pro výchovu MP ČSR, 1979, 45s.

KUCHYŇKA, Z., HALÍK, T.: Lidé a konflikty. 2.vyd Praha, Institut pro výchovu MP ČSR, 1986, 85s.

HLAVSA, J. a kolektiv: Psychologické problémy výchovy k tvořivosti. 1.vyd. Praha, SPedN, 1981, 240s., (s.173-180).

HALÍK, T.: Občanská výchova. red. Fischerová, D., 1.vyd., 2.část. Praha, Vyšehrad 1994, 88s., (s.18-29).

HALÍK, T.: Občanská výchova. red. Fischerová, D., 1.vyd., 3.část. Praha, Vyšehrad 1996, v tisku, (cca 10%).

HALÍK, T.: Mensch und Arbeit. in: Anstosse fur eine solidarische Welt (Lesebuch). 1.vyd., Augsburg, Sozialinstitut der KAB, 1994, 246s., (s.203-204).

Anno Domini, Artes y letras, Atheisme et Foi, Brithish Journal of Adiction, Communio, Crisis, Denken und Glauben, Diakonia, Dingir, First Things, Il Nuovo Areopago, Herder Korespondenz, L´altra Europa, La nuova Europa, Literární noviny, Kafka, Osservatore Romano, Osteuropeisches Christentum, Perspektivy, Psychologie dnes, Psychoterapeutické sešity, Prostor, Přítomnost, Protestant, Religion, State and Society, Religion in Communist Lands, Senát, Souvislosti, Studie, Nový život, Taiwan Church News, Teologické texty, Theologisches Bulletin, Tygodnik Powszechny, Unitas, Universum, Wiez, Znak etc.